Ilaiyaraaja dilahirkan sebagai Gnanadesikan di Pannaipuram,Daerah Theni , Tamil Nadu,India. Ilaiyaraaja merupakan seorang yang setia kepada agama Hindu dan an menjalani kehidupan yang amat warak. Ilaiyaraaja telah berkahwin dengan Jeeva dan pasangan itu mempunyai tiga anak iaitu Karthik Raja, Yuvan Shankar Raja dan Bhavatharini- Kesemua mereka ialah penyanyi dan komposer filem Tamil.